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《Science》: 如何阅读科学文献

作者:    信息来源:    发布时间: 2020-01-07

《Science》: 如何阅读科学文献



今天我们来分享一篇发表在 Science(IF: 41.06)上的文章,题目为“How to (seriously) read a scientific paper”,作者为Science杂志欧洲区的特约编辑Elisabeth Pain博士。


                                     



     Adam Ruben曾半开玩笑的总结过科学工作者对于阅读科学文献所面临的共同困惑。很多人会问我们如何阅读一篇科学文献,因此我们咨询了不同职业生涯的十几位科学工作者他们是如何阅读科学文献的。很明显虽然有经验的科学工作者阅读科学文献更加容易一些,但是仍然存在困难,每个科学家都有各自读文献的技巧,作者将这些科学家所讲的技巧编辑后清晰明了地呈现给读者朋友们。


你如何阅读一篇文献?


我首先阅读文献的摘要。然后我浏览简介后跳过结果部分直接看结果图。我尝试找出最重要的一到两个图,并且确保我理解了图所表达的意思。最后,我阅读结论部分。当我读完这些后我会回到方法技术部分来弄清楚我还有的其他问题。

- Jesse Shanahan, master's candidate in astronomy at Wesleyan University in Middletown, Connecticut


首先我通过阅读摘要和结论部分来对整篇文献获得一个整体的概念。结论帮助我理解摘要中总结的目标是否已达到,以及这篇文献是否是我科研工作所感兴趣的。我也经常看结果图,因为结果图帮助我对一篇文献有了最初的印象。然后,我通常根据文献呈现的顺序把整篇文献从头读到尾,这样我就可以跟随作者思路来理解文章内容。

如果你想更高效的阅读文献,你必须清楚自己最想知道的信息是哪些,然后聚焦这部分内容。也可以将你自己的结果和作者呈现的结果进行比较,在文中备注自己的分析,或者和最新发表的数据进行比较。参考文献部分会告诉读者同行们是如何做相似研究的,从而能帮助读者理清为什么这篇文献与你最相关。

- Cecilia Tubiana, scientist at the Max Planck Institute for Solar System Research in Göttingen, Germany


如果我只想获得关键内容,我将读摘要,然后跳到结果图,浏览讨论中的重点。我认为结果图是一篇文献中最重要的部分,因为文献的摘要和整体内容可以讲述一个引人入胜的故事。然后如果我还有什么不懂的内容,我将会去读方法部分。

如果我想深入的专研这篇文献,我将完整的读完整篇文章,然后我也会读来自于同一个课题组或其他课题组的与该文献同主题的以前的其他文献。如果某句话后面的参考文献我认为非常有意思或者存在争议,我也会继续读这篇参考文献的。如果我想获取更多的细节信息,我会进一步读作者提供的补充数据和相关信息。

然后,如果文献作者的研究领域与我自己的研究领域类似,我会进一步看他们相关的数据是否与我们的结果相匹配,是否存在不一致现象。如果存在不一致,我就会思考是什么原因导致的不一致。如果我们用了和文献作者一样的方法,我会进一步思考在我们的模型中出了什么问题?我可以向文献作者学习哪些东西?有时候,也要注意为什么作者要用特定的方法来做某个实验。文献作者为什么不用常规实验来解决某个科学问题?

- Jeremy C. Borniger, doctoral candidate in neuroscience at Ohio State University, Columbus


我经常从读文献题目和摘要开始。从读文献题目和摘要我可以明确这篇文献是否是我所感兴趣的,以及我是否能够真正从科学角度和语言角度来理解这篇文献。我然后会读简介部分来理解作者是如何提出科学问题的,之后我就直接跳到图表部分来理解实验结果。最后我会读讨论部分来理解这篇文章是如何与一般科学认知体系相统一的。

我会适当的关注一下致谢部分,有些人比其他人更容易夸大自己的贡献,这对我来说可能是个危险信号。我也经常从我流行病学家的角度来思考文献中的实验设计是否能证实其所提出的科学假设。

我进一步会深入阅读论证框架、图表和讨论部分,我也会思考哪部分是令人兴奋和新颖的?哪部分是生物学或逻辑上相关的?哪部分是被文献所支持的?我也会考虑哪部分与我已经存在的假设和研究问题相一致。

- Kevin Boehnke, doctoral candidate in environmental health sciences at the University of Michigan, Ann Arbor


我根据文献来决定我的阅读技巧。有时候我首先略读文献来看是否与我自己的科研相关。如果文献与我当前的研究主题直接相关,我会仔细读除了简介之外的文章其他部分,因为简介内容对我来说太熟悉了。但是我也会指出是否有特别的内容或特别的图需要我更加关注,然后我会读结果和讨论中的相关部分。

我也会看看是否有一些参考文献是我所感兴趣的。有时候我很好奇看看领域内谁的相关文献被引用了,我也会更关注谁的相关文献没被引用,以此来确定作者是不是会选择性地回避该研究领域内的特定方面的研究内容。我也发现事实上补充结果中经常有很有意思的结果,特别是如果这个结果与本领域内的一些作者刻意不引用的参考文献的内容相关,亦或是对解释整个故事没有任何帮助的结果。

- Gary McDowell, postdoctoral fellow in developmental biology at Tufts University in Medford, Massachusetts, and visiting scholar at Boston College


当我阅读文献的时候,我会用做笔记的方式来保持头脑活跃,不然我就会目光只盯着文字而不理解其中的意思。比如说,当我读背景介绍的时候,我会把特定主题文献中有用的句子整理到一个Word文档中。我会随时写批注以记录读文献过程中产生的新的想法或存在需要进一步确证的问题。以后,我只要读我整理好的文档而不是原始文献了。

同样地,当我想找出如何做一个特定的实验时候,我也会创建一个Excel表格来总结同行们所用到的各自特定的实验方案。

- Lina A. Colucci, doctoral candidate at the Harvard-MIT Health Sciences and Technology program


我经常从读摘要开始,读摘要给了我关于这个研究的一个简单印象。然后,我开始读除了方法外的整个文章,如果我不懂某个结果或者不熟悉某个实验,我也会读方法部分。

结果和方法部分允许你拆开一篇论文以确保科学的严谨性。我经常会思考该实验的类型,以及这些实验是否对作者提出的科学假设是最合适的实验。确保作者们已做了充足的对照试验。结论通常也是基于有限的样本,这也限制了其科学重要性。

我喜欢把文献打印出来,并把相关的信息加亮显示出来,这样一来当我再次快速阅读该文献时候,我能够重新记起这些重点内容。大部分相关重点内容将改变你对你研究课题的思考或者给你新的想法和方向。

- Lachlan Gray, deputy head of the HIV Neuropathogenesis Lab at the Burnet Institute and adjunct research fellow in the Department of Infectious Disease at Monash University in Melbourne, Australia


我选择读的文献是基于与我研究的相关度,或者能给我们相应的科学研究带来新的方向。我大部分时候要搞清楚文献中的方法问题,实验设计和统计学分析。对我来说,一篇文献最重要的部分是作者们用什么方法得到了什么结果。

能理解作者们为什么开展该研究(简介部分)以及该研究取得的结果的意义(讨论部分)是非常有意思的。当我阅读的文献是我熟知的领域时,我经常不关心简介部分和讨论部分,因为这两部分经常反映的是作者们的理论偏好,而我会更多的思考方法和结果部分。但是,当我读的文献是我不太熟悉的领域时,我会仔细阅读简介和讨论部分,因为这样我可以学习到很多关于该研究的假设和解释结果的途径。

- Brian Nosek, professor in the Department of Psychology at the University of Virginia and executive director of the Center for Open Science in Charlottesville


首先我会快速读一遍文献,目的是简单确认该文献是否是我所感兴趣的。如果是,我会仔细阅读第二遍。

如果该文献对我来说是至关重要的,且如果是一篇理论文献,我将不看文献内容,从起点开始自己解决该推理过程。有时候,该过程非常痛苦和缓慢。有时候我对作者摸棱两可、省略重要参数的写法非常生气。有时候,我会被某篇文献所震惊。

- Ulf Leonhardt, professor of physics at the Weizmann Institute of Science in Rehovot, Israel


我经常是先读摘要,如果摘要提示这篇文献对我有帮助,我会进一步读全文。其次,如果该文献的主题是我所熟知的领域,我经常会略读简介后读最后一段来明确该文献提出的特定科学问题。最后,我会读图和表,略读结果后略读或认真研读讨论部分。

如果该文献的主题我不太熟悉,我会仔细研读简介部分从而理解上下文的语境。然后,我会略读图和表,再读结果部分。

- Charles W. Fox, professor in the Department of Entomology at the University of Kentucky in Lexington


意识到阅读文献要有捷径是非常重要的,因为只有这样我们才会有多余的时间来做其他工作,比如写作、设计实验、参加会议、教学和撰写论文。当我还是一个博士研究生时,我会重点阅读学术文献的结论和方法部分,以及图书的特定章节而非通读整本书。

- Rima Wilkes, professor in the Department of Sociology at the University of British Columbia, Vancouver


作为科学杂志的主编,我经常要阅读和理解我专业知识领域外的文献。一般来说,我首先会读相应编辑的总结,这意味着像我这样博学的科学家虽然对各个方面都感兴趣,但是也仅仅在某一个领域有深入专研。其次,我会查一下是否有人为该文献写新闻报道。第三,我会查是否有其他科学家对该文献写过评论文章。评论文章的主要目的是拓宽文章信息面,但是通常作者们也同时为非专业人士提取了该文献的精髓。

然后我会回头来看摘要,摘要对于杂志读者群来说是一个广泛的交流途径。最后,我再来看文献本身,阅读简介、结论,略读图表,通读全文。

- Marcia K. McNutt, Editor-in-Chief, Science journals



在阅读文献过程中遇到不理解的部分你是如何做的?


我喜欢在线阅读文献,这样当我有不认识的单词时候我就可以直接黏贴到浏览器中查询其意思。

- McNutt


如果在阅读文献过程中只遇到了一小部分不理解的内容,我会先做个笔记回头再查。如果一篇文献对我来水晦涩难懂,我会先尝试阅读一篇综述文章或书本的特定章节来获取必要的背景知识,然后再来读文献效率就会提高很多。

阅读文献过程中经常会遇到难懂的缩写或专有名词,除非是我自己的研究领域,不然我不会深究其中的含义的。但是我经常会花时间去真正理解作者们所用到的实验方法。

- Shanahan


在阅读文献过程中遇到我所不理解的我会立刻查明其含义。如果我不理解某个重要的短语或专有名词,我继续阅读文献的其他内容毫无意义。虽然这经常会适得其反,但是我还是会经常打破砂锅问到底(比如X是什么?X影响了Y,那么Y又是什么?等等)。这有时候会非常有趣,你可以从中学习到事物之间的联系。但是如果你沉迷其中后会影响你手头正在开展的工作。

有时候文献中所有的专业术语在一开始就会使文章整体观点显得很混乱。在这种情况下,你自己问自己“作者们期望回答什么问题?”会对你阅读文献有帮助。然后通过阅读文献你可以判断出他们是否成功了。

- Borniger


当我阅读文献遇到不理解内容时候,我会权衡有多少不理解的内容,其是否阻碍了我进一步理解整篇文章的中心思想。当我第一次读某篇文献时候我通常不会去尝试理解所有章节的所有内容。如果不理解的内容对我的研究至关重要,我会尝试咨询同事或直接联系通讯作者咨询。因为时间宝贵,对于解决特定问题来说请求同事帮忙或通过联系通讯作者来解决的更有效的,所以当这两种办法行不通时最后的办法就是倒查最原始的参考文献来获得所有的背景信息。

- Tubiana


有时候,你可以先通读文献一遍,任何不懂的术语等读到最后的时候也就变的清晰明了了。如果个别术语非常难懂,这时候就需要停下来寻找别的解决办法了。我会用Google搜索主题、题目、方法、专业术语等。如果是一篇非常难懂的文章,有时候需要多通读几遍才可能完全理解。

- Gray


我问自己的问题是“我需要理解文献中这部分内容的意思吗”。我现在阅读的文章远远超出了我的专业范围,我通常只需要对实质内容有一些肤浅了解即可。为了更深入的了解文章内容,我会做更多的背景研究的查阅工作。

- Nosek


最近,我必须读很多含有许多我不熟悉的专业术语的我专业知识领域外的文献。有时候,我能够直接从结果和图表中获取我所需要的信息。另外一些时候,我需要用Google搜索来明确文章中专业术语和内容的含义,或通过阅读引用的文献来更好的理解关键问题。有时候,至少对我来说某些文献是很难理解的,以至于我都懒得去读它们了。

- Fox



你是否曾在阅读文献时感到不知所措?你是如何应对的?


我经常会遇到这样的问题。如果该文献对于我想解决的问题是相关的,我确信在该文献中有我不理解的重要内容。这种困惑不是压力,而是一种机会。说明我是无知的,我需要变得少一点无知,那么这篇文献可以帮到我。

同时,一些文献写的非常糟糕根本不值得我花时间去读。当然,也有人把内容写的更清楚的,这样我就可以把困惑集中在理解文章内容上而非糟糕的语法上。

- Nosek


如果我读的文献不是我自己所熟悉的研究领域、又很长且充满了专业术语我会感到不知所措。当这种情况发生时,我会把它分成几个部分,如果有可能我会在几天内读完。对于特别难的文献,如果能和同事坐下来一起研读会更有帮助。

- Shanahan


是的,经常。这就是为什么我通过与其他科学家交谈、通过反复实验最终形成了我自己的阅读技巧。我也曾沮丧地举起双手扔掉哪些令我困惑的文献后再也不读它们。

- Boehnke


是的,在这种情况下,你必须意识到有些论文是几十位科学家多年研究的结果。指望在一个下午就消化和理解其中的一切,是一个牵强附会的想法。

- Borniger


我经常感到不知所措!但是某些部分可能不需要像其他部分一样被深刻理解。你也需要了解你自己的局限:你希望模仿的某些内容是不是不是你的专长?是否可以通过合作来更轻松容易实现你的目标?

- Tubiana


如果我认为这篇文献对我正在做的工作非常重要,当我感到不知所措时候我会放手一段时间然后再来多读几次。但是如果该文献实在是太难被理解了,我也会放到一边不再阅读,除非我能联系到熟悉该领域的同事帮我解释。

- McDowell



你还有其他的技巧可以分享吗?


如果某篇文献意义深远,我需要透彻理解,我会用组会报告的形式来呈现该篇文献。在文献学习组会上通过讲解该文献,同行们提问是很好的进一步理解和学习机会。

管理好参考文献也很重要,这会帮助我来做研究、阅读文献和撰写文章。

- Colucci


一开始,因为没有掌握阅读技巧,新的学术工作者会发现阅读很慢。但是有很多方法可以把阅读作为一种建立大脑图书馆的系统,经过几年训练,把所阅读文献放到你大脑图书馆的特定位置将会变的容易。那时你就可以通过略读文献来理解作者的贡献了。

- Wilkes


耐心点。不要害怕或羞于通过维基百科或其他渠道如博客等来理解你的主题。一定要多问问题。如果你不能很好的理解一篇文献,与你周围的人多探讨。如果这还不能解决你的困惑,通过给作者写邮件来帮助解决也很重要。

- Boehnke


不要犹豫,去和更多更有经验的科学家讨论。通过让这些科学家用你理解的术语来解释一遍一篇复杂文献的话你将会帮这些科学家一个忙。所有的科学家们都需要更多的经验来将复杂的概念转化成通俗的语言。

- McNutt


有可能的情况下尽可能多读。尝试保存一个参考文献文件夹,这个文件夹包括文章的总结、重点、甚至是一两张图和引文信息。注意不同的文章结构,注意不同的写作风格。这将帮助你形成一种既有效又独特的风格。

- Shanahan


编辑总结


Sience杂志采访了数十位领域内优秀科学家们阅读文献的技巧,编辑简要总结技巧如下:

优先阅读:题目→摘要→图表

重点阅读:结果图(理解文献精髓);方法(针对特定的科学研究需要);简介和讨论(针对不是自己所熟知的研究领域)。

难点阅读:通过搜索引擎自己主动查阅;和同事探讨;邮件咨询通讯作者。

总之,根据个人习惯掌握有效的阅读技巧对于科研工作者来说至关重要,良好的阅读习惯和技巧在科学研究过程中会起到事半功倍的效果。希望通过翻译本文优秀科学工作者倾囊相授的阅读技巧,能对初入门的科研工作者提供一点帮助,期待每位科研工作者都能拥有自己独特的文献阅读技巧来助力自身科研发展!

来源:生物医学科研宝典


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